德军最初的攻击目标是西北方面军的莫罗佐夫第11集团.巴甫洛夫将军指挥的在白俄罗斯的整个西方方面军。西方方面军在边境上部署有第3团军、第1o团军和第4团军每个集团军都下辖一个机械化军。除此之外在方面军预备队中还有一个机械化军和一个骑兵军。
霍特大将的第3甲集群同北方集团军群的克莱斯特大将的第4甲集群齐头并进从东普鲁士攻入立陶宛。第3甲集群在越过沙土地带时也遇到了茂密的森林和几乎没有道路的困难。敌人在这里的抵抗比在北部更为坚决。内务人民委员部的一些边防部队虽然没有任何炮火支援却奋战到底。阻止装甲集群前进的立陶宛军进行了出乎意料的顽强抵抗。为数不多的由西向东的道路只不过是一些狭窄的林间沙土小道。其中很多从未有车辆行驶过。尽管敌人的抵抗很轻微但很难离开道路来展开部队克服抵抗。结果部队的前进一再受阻多次的森林大火使情况更为混乱。任何车辆陷在路上或生故障道路就完全堵塞。在纵横交错的河流上的木桥不得不加固以便通行车辆。在勃劳希契的坚持下有些道路划归步兵使用。可是事实上不论是对步兵还是对装甲部队来说道路是太少了。一个被分配使用一条道路的步兵师行军长达二十二英里通过某一个地点要花费一整天时间。当骡马牵引的运输车和火炮有落在装甲部队后面太远的危险时它们经常违反命令离开指定的路线挤到装甲部队的行军路上常常堵塞道路或减慢摩托化部队前进的度。第19装甲师被一个由近两千辆德国空军卡车组成的车队挡在途中达数小时之久。这些卡车没有按照车辆行军计划表行动其中很多装载着电线杆。第9集团>.&师前进要求这些师把它们有限的摩托车辆集中起来组成机动小分队。这些摩托化小分队走的是装甲部队的行军路线因为除此之外别无快道路可用。
在上述重重困难情况下鲁道夫.施密特的第39装甲军和孔57装甲军起初行进缓慢直到6月23中午才到达离东普鲁士边界三十到四十英里的涅曼河上的公路桥。苏联指挥官按照惯例把装甲机械化军留下来难备对付挺进的德军部队的两翼。但是由于通信引起的混乱和德国空军的袭击他们无法使全部机械化部队协调一致地进行反突击。6月23日第7装甲师向涅曼河公路桥前进时次遇到严重的抵抗。向它攻击的是来自附近瓦列纳坦克训练场的苏军装甲部队据信是苏联第坦克师的部队。他们作战十分坚决。一位曾在法国作过战的德军装甲团团长报告说这次是他所经历过的最激烈的战斗。可是这支苏军坦克部队由于训练和指挥不如德军在几个小时之内便被消灭了。
苏联边界这一方混乱已极。凯塞林的航空队已把苏军的飞机驱除干净并对所有地面活动进行持续而猛烈的轰炸。成群结队的难民包括地方官员和士兵家属试图逃出作战地区。部分白俄罗斯人和乌克兰人对苏联殖民主义者和苏军持公开的敌对态度。民族主义分子和德国招募的出没农村的武装人员的活动再加上人们的渲染更加重了难民的恐怖和